.CRAM-tiedostotunniste

Kirjoittaja: John Stephens
Luomispäivä: 1 Tammikuu 2021
Päivityspäivä: 17 Saattaa 2024
Anonim
.CRAM-tiedostotunniste - Laajentaminen
.CRAM-tiedostotunniste - Laajentaminen

Sisältö

TiedostotyyppiCompressed Alignment File

KehittäjäEBI
Suosio 3.0 (1 ääni)
KategoriaTiedostot
MuotoBinary X

Binääri

Tämä tiedosto tallennetaan binaarimuodossa, joka edellyttää tietyn ohjelman lukemista.


Mikä on CRAM-tiedosto?

Euroopan molekyylibiologian laboratorion outstationin EBI: n kehittämä pakattujen linjaustiedostojen muoto; tallentaa lyhyitä DNA-sekvenssin lukukäskyjä, jotka on luotu lyhyistä lukemista osoittavista alignereistä, kuten BWA, BBMap ja BLAT. Lisää tietoa

CRAM-tiedostomuoto on samanlainen kuin Binary Alignment / Map (BAM) -tiedostomuoto, mutta siinä on parempi tiedoston pakkaus ja uudelleenjärjestetty sarakekeskeinen binäärisäiliön muoto. Kun tietovolyymit lisääntyvät geneettisessä ohjelmistokentässä, CRAM-muoto on suunniteltu vähentämään kohdistustietojen levyn jalkajälkiä.

Lyhyt lukukohdistus on prosessi, jossa sekvenssi tulee genomista. Tämä voi olla vaikeaa, koska referenssigenomi on melko suuri ja et aina etsi tarkkoja vastaavuuksia vertailu genomissa. Lyhyitä lukemistajia käytetään etsimään valtavia sekvenssejä otteluille ja lähellä otteluille. Koska sekvenssit ovat niin suuria, CRAM-muotoisten formaattien aikaansaama pakkaus on välttämätön tiedostojen koon hallittavaksi.


ILMAINEN LATAA Lataa File Viewer Android-ohjelmille, jotka avaavat CRAM-tiedostot
Windows
Samtools
Päivitetty 11.11.2016

Tietoja CRAM-tiedostoista

Tavoitteenamme on auttaa sinua ymmärtämään, mitä tiedostoa * .cram-päätteellä on ja miten se avataan.

FileInfo-tiimi on yksilöllisesti tutkinut ja tarkistanut tällä sivulla luetellut pakatun kohdistustiedoston tyypin, tiedostomuodon kuvauksen ja Windows-ohjelmat. Pyrimme 100%: n tarkkuuteen ja julkaisemme vain tietoja tiedostomuodoista, jotka olemme testanneet ja vahvistaneet.

Jos haluat ehdottaa tämän sivun lisäyksiä tai päivityksiä, ilmoita siitä meille.

SMAF-tiedostomuodon kuvaus

Morris Wright

Saattaa 2024

Monet ihmiet jakavat .maf tiedotoja liittämättä en käyttöä kokevia ohjeita. Kaikille ei kuitenkaan ole elvää, mikä ohjelma a .maf tiedotoa voidaan muokata...

ZGR-tiedostomuodon kuvaus

Morris Wright

Saattaa 2024

Monet ihmiet jakavat .zgr tiedotoja liittämättä en käyttöä kokevia ohjeita. Kaikille ei kuitenkaan ole elvää, mikä ohjelma a .zgr tiedotoa voidaan muokata...

Kiehtovia Artikkeleita